In zijn onderzoek in de Ethics of Belief heeft Peels theorieën over verantwoord geloof en onwetendheid ontwikkeld. Daarnaast is hij kritisch op het sciëntisme en heeft hij onderzoek gedaan naar de epistemische verantwoordelijkheden van universiteiten.

Momenteel is hij leider van het het ERC project Extreme Beliefs: The Epistemology and Ethics of Fundamentalism (zie www.extremebeliefs.com) en is hij co-leider van een project over vooruitgang in de universiteit. Peels is co-auteur van de boeken Wat is nou waar? (2023), En God zag dat het goed was (2019) en God bewijzen (2013).