Mak doet onderzoek naar gendergeschiedenis, voornamelijk aan de hand van case studies. Ze kijkt daarbij onder andere naar sekse, seksualiteit, sekse-identiteiten en hoe identiteit wordt vormgegeven door lichamelijke verschillen. Hoe definiëren we ‘mannelijk’ en ‘vrouwelijk’?

Daarnaast is ze onderzoeker bij NL-Lab (KNAW), een onderzoeksgroep die de Nederlandse cultuur en identiteit in heden en verleden bestudeert. Naast gendergeschiedenis behoren ook migratiegeschiedenis, wetenschapsgeschiedenis en koloniale geschiedenis tot haar onderzoeksterreinen.