Agtenberg studeerde Theater-, Film- en Televisiewetenschap aan de Universiteit Utrecht. Hij doceerde aan de Universiteit Utrecht en de Hogeschool voor de Kunsten, en produceerde een aantal films voor Jos Stelling. Met hem ontwikkelde hij ook de Utrechtse arthouse bioscoop Louis Hartlooper Complex, waar hij als directeur van de gelijknamige stichting, lezingen, festivals en tentoonstellingen in het Universiteitsmuseum organiseerde. Bij het Nederlands Instituut voor Beeld en Geluid leidt Agterberg publicatieprojecten, met als doel achtergronden in de collecties te onderzoeken en ontsluiten, zoals in de Beeld en Geluid wiki. Zijn onderzoeksinteresse ligt op het gebied van de ontwikkeling van mediatechnologie en culturele identiteit in nationale film en televisie.