Mutsvairo doet onderzoek naar de complexe relatie tussen journalistiek, technologie en democratie, vooral in niet-Westerse samenlevingen. Hij onderzoekt bijvoorbeeld de rol die sociale media spelen bij protest, en de positie van journalistiek in een democratie.

Naast zijn werk bij de Universiteit Utrecht bekleedt Mutsvairo ook een UNESCO-leerstoel op het gebied van Data, Desinformatie en Democratie. Hiervoor doet hij onderzoek naar de sociale en politieke invloed die digitale technologie heeft op de moderne maatschappij. Hij richt zich onder andere op de rol van desinformatie in gewapende conflicten.