Bleys is een allround anatoom en vooral gespecialiseerd in het hoofd-hals gebied. In zijn recente onderzoek focust hij zich op de rol van het autonome zenuwstelsel bij de regulatie van ontstekingsreacties. Hiernaast werkt hij samen met artsen in klinisch anatomische onderzoeksprojecten, onder meer gericht op slokdarmkanker operaties. Ook is Bleys betrokken bij onderwijsinnovaties, zoals het ontwikkelen en toepassen van virtuele 3D anatomie modellen.

Bleys is bestuurslid van de Nederlandse Anatomen Vereniging. In 2013 werd hij verkozen tot ‘Docent van het jaar’ van de Universiteit Utrecht.