In zijn onderzoek focust Schot zich op het integreren van sociale wetenschap en historische perspectieven voor een beter begrip van de aard en het bestuur van radicale socio-technologische verandering. Binnen zijn onderzoek houdt hij zich met name bezig met techniekgeschiedenis en duurzaamheidstransities. Op het moment onderzoekt hij Deep Transitions, transities die lange termijnprocessen behelzen en zowel maatschappij als economie fundamenteel veranderen.

Schot publiceerde extensief over de creatie van de Europese Unie, en schreef het boek ‘Writing the Rules for Europe’.

Schot werkte van 2014 tot 2018 aan de Universiteit van Sussex als directeur van SPRU (Science Policy Research Unit). Hiervoor had hij verschillende aanstellingen aan de Technische Universiteit Eindhoven (TUe) en de Universiteit Twente (UT). In 2009 werd Schot benoemd tot lid van de KNAW (Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen).