Tot 1988 werkte hij daar ook als docent in de toegepaste wiskunde. Sinds 1988 is hij hoogleraar en hoofd van de afdeling Medische Beeldvorming en Beeldverwerking aan de Universiteit Utrecht. Daarnaast is hij sinds 1989 mede verbonden aan Natuurkunde en vanaf 1996 ook aan Informatica aan de UU. Sinds 1996 is hij wetenschappelijk directeur van het Image Sciences Institute bij het Universitair Medisch Centrum en sinds 1998 directeur van de onderzoekschool Biomedical Image Sciences. Zijn onderzoeksgebied omvat alle aspecten van medische beeldvorming en beeldverwerking.