Ze onderzoekt groei en adaptatie van weefsels en kweekt hiervoor weefsel in het laboratorium, onder meer uit stamcellen.

Bouten studeerde bewegingswetenschappen aan de Vrije Universiteit Amsterdam en behaalde haar doctoraat aan de TU/e, waarna ze postdoctoraal onderzoek deed aan de Université Laval in Quebec, de Queen Mary University in Londen en aan de TU/e. In 1998 werd Bouten daar benoemd tot universitair docent cellulaire biomechanica en in 2002 tot universitair hoofddocent tissue engineering. In dat jaar werd zij beloond door het NWO-Aspasia programma dat vrouwelijke vertegenwoordiging in de wetenschappelijke top stimuleert en het jaar daarop ontving zij een Vici-beurs voor haar onderzoek naar tissue engineering van spierweefsel en hartkleppen.